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基因调控与设计研究组

研究

科学理想

  • 充分理解和创造性使用生命语言
  • 充分理解和工程化改造细胞状态
  • 实现健康衰老和治愈神经退行性疾病

What I cannot create, I do not understand.

— Richard Feynman

系统性理解转录因子与共同调控因子的多层次功能

从蛋白质序列到个体,并跨越物种,系统性地理解调控因子在每个层面的功能。

  • 序列:蛋白质序列基础。
  • 生物物理:蛋白质与 DNA、RNA 及其他分子的互作。
  • 基因:基因表达的体外与体内调控。
  • 细胞状态与个体:细胞状态的整体变化,个体表型的变化。
  • 进化:比较基因组学,从模式生物到人类。

利用高通量设计与合成能力进行调控因子设计与细胞状态改造

为特定功能设计与合成调控因子,在高通量扰动实验中检验,并把每一轮结果反馈到模型中。

  • 序列设计与合成:生物功能驱动的序列设计与合成。
  • 高通量扰动与观测:高通量扰动与观测实验体系。
  • 迭代:整合实验信息,实现知识与模型能力的迭代。
  • 改造:改造衰老与疾病相关的细胞状态。

衰老与神经退行性疾病的信息整合与假设生成

在分子、细胞与个体层面整合数据构建知识图谱,并在其上建立 AI co-scientist,提出下一轮的假设与实验。

  • 知识图谱:在分子、细胞、个体层面整合数据,构建知识图谱。
  • AI co-scientist:建立基于知识图谱的 AI co-scientist 体系。
  • 下一轮迭代:利用 AI 整合信息,进行假设生成、实验设计与数据分析。
  • 临床转化:利用 AI 将模式生物与实验室系统应用到临床和转化研究。